ROSA Forum • wirtualenvwrapper pip install psycopg2 с ошибкой undefined reference to `floor'

wirtualenvwrapper pip install psycopg2 с ошибкой undefined reference to `floor'

Добавлено: 27 июн 2016, 07:31

agedz

Нужна помощь с проблемой компиляции пакетов в окружение(virtualenv)
1. установил wirtualenvwrapper
2. создал окружение и
3. при установке pip install psycopg2==2.6.1 или pip install -r requirements.txt
в общем пакеты которые должны собираться из исходников не могут быть скомпилированы по причине

undefined reference to `floor'
undefined reference to `round'

эти функции входят в библиотеку стандартную Math
но почему то автоматически не линкуются (я думаю что должны)
я только перешел на ваш дистрибутив, до этого работал на Ubuntu LTS так вот там я с таким никогда не сталкивался(обычно проблемы были в не установленной библиотеке)

как я понял из http://stackoverflow.com/questions/1033 ... brary-in-c
у меня установлен libstdc++6 и по идее должно автоматом линковать math библиотеку при компиляции чего не происходит

при установке других пакетов тоже происходят ошибки связанные с линком библиотек хотя выставлен флаг -Wl,--no-as-needed
которые как я понимаю как раз и говорят gcc что нужно подключать библиотеки по необходимости

проблема происходит только внутри окружения, если просто устанавливать в системе все работает нормально

$ uname -a
Linux agedz-x1-carbon 4.1.25-nrj-desktop-1rosa-x86_64 #1 SMP PREEMPT Tue May 24 16:25:10 UTC 2016 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

для примера полный вывод для psycopg2:

Re: wirtualenvwrapper pip install psycopg2 с ошибкой undefined reference to `floor'

Добавлено: 28 июн 2016, 11:57

d_uragan

agedz писал(а): эти функции входят в библиотеку стандартную Math
но почему то автоматически не линкуются (я думаю что должны)
я только перешел на ваш дистрибутив, до этого работал на Ubuntu LTS так вот там я с таким никогда не сталкивался(обычно проблемы были в не установленной библиотеке)

как я понял из http://stackoverflow.com/questions/1033 ... brary-in-c
у меня установлен libstdc++6 и по идее должно автоматом линковать math библиотеку при компиляции чего не происходит

Нет, библиотека math у нас по умолчанию не линкуется, ее надо явно указывать во флагах компиляции. В случае с модулями python надо указывать соответсвующие опции/параметры в setup.py. К сожалению, разработчики некоторых модулей тоже считают, что флаги типа "-lm" должны подставляться автоматом.

Btw, psycopg2 у нас собран в репозитории, можете поставить пакет python-psycopg2. И можете посмотреть на небольшой патч к его setup.py, который мы накладываем, чтобы его собрать в Росе, я его послал сейчас в апстрим, может вмерджат - https://github.com/psycopg/psycopg2/pull/445.

Re: wirtualenvwrapper pip install psycopg2 с ошибкой undefined reference to `floor'

Добавлено: 06 июл 2016, 10:48

agedz

virtualenvwrapper нужен для нескольких проектов на разном окружении и в части из них будет использован этот пакет psycopg2, но опять же вместо него может быть и другие которые собираются из исходников, и дело в том что под каждый из них вы же не будете создавать пакет в системе, тем более что использовать разные окружения не получится через virtualenvwrapper или по простому в virtualenv так как процесс несколько усложняется, да и проблема как мне кажется в том что virtualenv не находит библиотеки установленные в системе. В убунту это работает корректно.
Так провел эксперимент над пакетом Pillow для python3
1. удалил пакет который ставит его python3-pillow
2. попробовал его установить(потребовал lib64jpeg)
pip3 install Pillow

3. установлен из исходников
это если не в окружении(в окружение если не изменяет память пробовал, не работает)

еще раз проверил в окружении:
не компилируется и ругается

то есть проблема возникает только внутри virtualenv
возможно нужно какие линки библиотек или пути поправить и это буде работать